Le competenza dell'Area II sono ripartite tra i diversi Uffici e relativi Servizi; le attività di programmazione si riferiscono a finanziamenti ordinari, a finanziamenti speciali, intese e accordi di programma, in materia di Lavori Pubblici dei beni culturali sottoposti a tutela e valorizzazione; le attività tecniche sono orientate alla realizzazione degli interventi programmati e anche alla gestione e manutenzione architettonica e impiantistica della Sede; così come tutta l'attività richiesta dalle procedure di gare volte all'affidamento dei lavori e dei servizi programmati e delle forniture. Il ruolo di Stazione Appaltante che compete al Segretariato ex lege, si esplica su tutti gli interventi ricadenti nell'intero territorio regionale.